DELLA প্রোটিনগুলি সংরক্ষিত প্রধানবৃদ্ধি নিয়ন্ত্রকযা অভ্যন্তরীণ এবং পরিবেশগত সংকেতের প্রতিক্রিয়ায় উদ্ভিদের বিকাশ নিয়ন্ত্রণে একটি কেন্দ্রীয় ভূমিকা পালন করে। DELLA একটি ট্রান্সক্রিপশনাল নিয়ন্ত্রক হিসেবে কাজ করে এবং এর GRAS ডোমেনের মাধ্যমে ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টর (TF) এবং হিস্টোন H2A-এর সাথে আবদ্ধ হয়ে টার্গেট প্রোমোটারগুলিতে যুক্ত হয়। সাম্প্রতিক গবেষণায় দেখা গেছে যে DELLA-এর স্থায়িত্ব দুটি প্রক্রিয়ার মাধ্যমে পোস্ট-ট্রান্সলেশনালি নিয়ন্ত্রিত হয়: ফাইটো হরমোন জিবেরেলিন দ্বারা প্ররোচিত পলিউবিকুইটিনেশন, যা এর দ্রুত অবক্ষয় ঘটায়, এবং এর সঞ্চয় বাড়ানোর জন্য ছোট ইউবিকুইটিন-সদৃশ মডিফায়ার (SUMO)-এর সংযোজন। এছাড়াও, DELLA-এর কার্যকলাপ দুটি ভিন্ন গ্লাইকোসিলেশন দ্বারা গতিশীলভাবে নিয়ন্ত্রিত হয়: O-ফিউকোসিলেশন দ্বারা DELLA-TF মিথস্ক্রিয়া বৃদ্ধি পায় কিন্তু O-লিঙ্কড N-অ্যাসিটাইলগ্লুকোসামিন (O-GlcNAc) মডিফিকেশন দ্বারা বাধাপ্রাপ্ত হয়। তবে, DELLA ফসফোরাইলেশনের ভূমিকা এখনও অস্পষ্ট, কারণ পূর্ববর্তী গবেষণায় পরস্পরবিরোধী ফলাফল দেখা গেছে; কিছু গবেষণায় দেখা গেছে যে ফসফোরাইলেশন DELLA-এর অবক্ষয়কে উৎসাহিত বা হ্রাস করে, আবার অন্য গবেষণায় দেখা গেছে যে ফসফোরাইলেশন এর স্থায়িত্বকে প্রভাবিত করে না। এখানে, আমরা REPRESSOR-এ ফসফোরাইলেশন সাইটগুলি শনাক্ত করি।ga1-3ম্যাস স্পেকট্রোমেট্রি বিশ্লেষণের মাধ্যমে অ্যারাবিডোপসিস থ্যালিয়ানা থেকে বিশুদ্ধকৃত (RGA, AtDELLA) নমুনা থেকে দেখা যায় যে, PolyS এবং PolyS/T অঞ্চলে দুটি RGA পেপটাইডের ফসফোরাইলেশন H2A বন্ধনকে উৎসাহিত করে এবং RGA-এর কার্যকারিতা বৃদ্ধি করে। লক্ষ্য প্রমোটারগুলির সাথে RGA-এর সংযোগও ঘটে। উল্লেখযোগ্যভাবে, ফসফোরাইলেশন RGA-TF মিথস্ক্রিয়া বা RGA-এর স্থিতিশীলতাকে প্রভাবিত করে না। আমাদের এই গবেষণাটি সেই আণবিক প্রক্রিয়াটি উন্মোচন করে, যার মাধ্যমে ফসফোরাইলেশন DELLA-এর কার্যকারিতাকে প্ররোচিত করে।
DELLA-এর কার্যকারিতা নিয়ন্ত্রণে ফসফোরাইলেশনের ভূমিকা স্পষ্ট করার জন্য, জীবন্ত কোষে (in vivo) DELLA ফসফোরাইলেশন স্থানগুলি শনাক্ত করা এবং উদ্ভিদে কার্যকরী বিশ্লেষণ সম্পাদন করা অত্যন্ত গুরুত্বপূর্ণ। উদ্ভিদের নির্যাসের অ্যাফিনিটি পিউরিফিকেশন এবং তারপরে MS/MS বিশ্লেষণের মাধ্যমে, আমরা RGA-তে বেশ কয়েকটি ফসফোসাইট শনাক্ত করেছি। GA-এর ঘাটতির পরিস্থিতিতে, RHA ফসফোরাইলেশন বৃদ্ধি পায়, কিন্তু ফসফোরাইলেশন এর স্থিতিশীলতাকে প্রভাবিত করে না। গুরুত্বপূর্ণভাবে, co-IP এবং ChIP-qPCR পরীক্ষাগুলি প্রকাশ করেছে যে RGA-এর PolyS/T অঞ্চলে ফসফোরাইলেশন H2A-এর সাথে এর মিথস্ক্রিয়া এবং লক্ষ্য প্রমোটারগুলির সাথে এর সংযোগকে উৎসাহিত করে, যা ফসফোরাইলেশনের মাধ্যমে RGA-এর কার্যকারিতা প্ররোচিত করার প্রক্রিয়াটি প্রকাশ করে।
RGA তার LHR1 সাবডোমেনের সাথে TF-এর মিথস্ক্রিয়ার মাধ্যমে টার্গেট ক্রোমাটিনে যুক্ত হয় এবং তারপর তার PolyS/T অঞ্চল ও PFYRE সাবডোমেনের মাধ্যমে H2A-এর সাথে আবদ্ধ হয়ে H2A-RGA-TF কমপ্লেক্স গঠন করে RGA-কে স্থিতিশীল করে। একটি অজ্ঞাত কাইনেজ দ্বারা DELLA ডোমেন এবং GRAS ডোমেনের মধ্যবর্তী PolyS/T অঞ্চলে Pep 2-এর ফসফোরাইলেশন RGA-H2A বন্ধনকে শক্তিশালী করে। rgam2A মিউট্যান্ট প্রোটিনটি RGA ফসফোরাইলেশনকে বিলুপ্ত করে এবং H2A বন্ধনে বাধা দেওয়ার জন্য একটি ভিন্ন প্রোটিন কনফরমেশন গ্রহণ করে। এর ফলে ক্ষণস্থায়ী TF-rgam2A মিথস্ক্রিয়া অস্থিতিশীল হয়ে পড়ে এবং rgam2A টার্গেট ক্রোমাটিন থেকে বিচ্ছিন্ন হয়ে যায়। এই চিত্রটি শুধুমাত্র RGA-মধ্যস্থ ট্রান্সক্রিপশনাল দমনকে চিত্রিত করে। RGA-মধ্যস্থ ট্রান্সক্রিপশনাল অ্যাক্টিভেশনের ক্ষেত্রেও একটি অনুরূপ প্যাটার্ন বর্ণনা করা যেতে পারে, তবে এক্ষেত্রে H2A-RGA-TF কমপ্লেক্সটি টার্গেট জিনের ট্রান্সক্রিপশনকে উৎসাহিত করবে এবং rgam2A-এর ডিফসফোরাইলেশন ট্রান্সক্রিপশন কমিয়ে দেবে। চিত্রটি Huang et al.21 থেকে পরিমার্জিত।
সমস্ত পরিমাণগত ডেটা এক্সেল ব্যবহার করে পরিসংখ্যানগতভাবে বিশ্লেষণ করা হয়েছিল এবং স্টুডেন্ট'স টি টেস্ট ব্যবহার করে তাৎপর্যপূর্ণ পার্থক্য নির্ধারণ করা হয়েছিল। নমুনার আকার প্রাথমিকভাবে নির্ধারণ করার জন্য কোনো পরিসংখ্যানগত পদ্ধতি ব্যবহার করা হয়নি। বিশ্লেষণ থেকে কোনো ডেটা বাদ দেওয়া হয়নি; পরীক্ষাটি এলোমেলোভাবে করা হয়নি; পরীক্ষা চলাকালীন এবং ফলাফল মূল্যায়নের সময় গবেষকরা ডেটার বিন্যাস সম্পর্কে অবগত ছিলেন। নমুনার আকার চিত্রের বিবরণে এবং উৎস ডেটা ফাইলে উল্লেখ করা আছে।
গবেষণাটির নকশা সম্পর্কে আরও তথ্যের জন্য, এই নিবন্ধের সাথে সংযুক্ত ন্যাচারাল পোর্টফোলিও রিপোর্ট অ্যাবস্ট্রাক্টটি দেখুন।
PRIDE66 পার্টনার রিপোজিটরির মাধ্যমে ডেটাসেট আইডেন্টিফায়ার PXD046004 ব্যবহার করে ম্যাস স্পেকট্রোমেট্রি প্রোটিওমিক্স ডেটা ProteomeXchange কনসোর্টিয়ামে জমা দেওয়া হয়েছে। এই গবেষণাকালে প্রাপ্ত অন্যান্য সমস্ত ডেটা সাপ্লিমেন্টারি ইনফরমেশন, সাপ্লিমেন্টারি ডেটা ফাইলস এবং র ডেটা ফাইলস-এ উপস্থাপন করা হয়েছে। এই প্রবন্ধের জন্য ডেটার উৎস প্রদান করা হয়েছে।
পোস্ট করার সময়: ০৮-নভেম্বর-২০২৪
